Indels < MITOMAP

You are here: Foswiki>MITOMAP Web>Indels (20 Jan 2023, UnknownUser)Edit Attach

Indel Variants Converted to Comply with HGVS Three Prime Rule

Index	Old Variant				New Variant
Index	Name	Pos	Ref	Alt	Name	Pos	Ref	Alt
1	m.24del	24	A	:	m.25del	25	A	:
2	m.26del	26	C	:	m.27del	27	C	:
3	m.34del	34	G	:	m.36del	36	G	:
4	m.43del	43	C	:	m.44del	44	C	:
5	m.46_47insGC	46	T	TGC	m.47_48dup	48	C	CGC
6	m.53del	53	G	:	m.54del	54	G	:
7	m.56_57insTT	56	A	ATT	m.59_60dup	60	T	TTT
8	m.57del	57	T	:	m.60del	60	T	:
9	m.65_66insGG	65	T	TGG	m.70_71dup	71	G	GGG
10	m.66del	66	G	:	m.71del	71	G	:
11	m.102_103insGG	102	A	AGG	m.103_104insGG	103	G	GGG
12	m.104del	104	C	:	m.105del	105	C	:
13	m.112del	112	C	:	m.114del	114	C	:
14	m.133del	133	T	:	m.135del	135	T	:
15	m.138del	138	T	:	m.139del	139	T	:
16	m.144del	144	C	:	m.145del	145	C	:
17	m.150del	150	C	:	m.151del	151	C	:
18	m.154del	154	T	:	m.155del	155	T	:
19	m.157del	157	T	:	m.159del	159	T	:
20	m.166del	166	C	:	m.167del	167	C	:
21	m.172del	172	T	:	m.173del	173	T	:
22	m.175del	175	A	:	m.176del	176	A	:
23	m.184del	184	G	:	m.185del	185	G	:
24	m.195del	195	T	:	m.196del	196	T	:
25	m.200del	200	A	:	m.202del	202	A	:
26	m.202_203insGTGTGTT	202	A	AGTGTGTT	m.203_209dup	209	T	TGTGTGTT
27	m.208del	208	T	:	m.209del	209	T	:
28	m.208_211del	208	TTAA	:	m.216_219del	216	TTAA	:
29	m.231_232insATA	231	C	CATA	m.238_240dup	240	A	AATA
30	m.245del	245	T	:	m.246del	246	T	:
31	m.248del	248	A	:	m.249del	249	A	:
32	m.265del	265	T	:	m.267del	267	T	:
33	m.283del	283	A	:	m.284del	284	A	:
34	m.285_286insAA	285	C	CAA	m.290_291dup	291	A	AAA
35	m.286del	286	A	:	m.291del	291	A	:
36	m.286_287del	286	AA	:	m.290_291del	290	AA	:
37	m.290_291insAT	290	A	AAT	m.291_292dup	292	T	TAT
38	m.290_291insATAT	290	A	AATAT	m.291AT[3]	292	T	TATAT
39	m.298del	298	C	:	m.299del	299	C	:
40	m.302_303insCC	302	A	ACC	m.308_309dup	309	C	CCC
41	m.302_303insCCC	302	A	ACCC	m.307_309dup	309	C	CCCC
42	m.302_303insCCCC	302	A	ACCCC	m.306_309dup	309	C	CCCCC
43	m.303del	303	C	:	m.309del	309	C	:
44	m.309_310insTT	309	C	CTT	m.310_311insTT	310	T	TTT
45	m.310_311insCC	310	T	TCC	m.314_315dup	315	C	CCC
46	m.310_311insCCC	310	T	TCCC	m.313_315dup	315	C	CCCC
47	m.310_311insCCCC	310	T	TCCCC	m.312_315dup	315	C	CCCCC
48	m.311del	311	C	:	m.315del	315	C	:
49	m.311_312del	311	CC	:	m.314_315del	314	CC	:
50	m.318del	318	T	:	m.319del	319	T	:
51	m.322del	322	G	:	m.323del	323	G	:
52	m.324del	324	C	:	m.325del	325	C	:
53	m.335del	335	A	:	m.337del	337	A	:
54	m.339_340insCAT	339	A	ACAT	m.340_342dup	342	T	TCAT
55	m.357del	357	A	:	m.361del	361	A	:
56	m.362_363insAAAG	362	C	CAAAG	m.363_366dup	366	G	GAAAG
57	m.363del	363	A	:	m.365del	365	A	:
58	m.369del	369	C	:	m.371del	371	C	:
59	m.373del	373	A	:	m.374del	374	A	:
60	m.381del	381	C	:	m.382del	382	C	:
61	m.391del	391	T	:	m.393del	393	T	:
62	m.395del	395	A	:	m.397del	397	A	:
63	m.405del	405	T	:	m.408del	408	T	:
64	m.433del	433	C	:	m.438del	438	C	:
65	m.449del	449	T	:	m.450del	450	T	:
66	m.451_452insTT	451	A	ATT	m.454_455dup	455	T	TTT
67	m.451_452insTTT	451	A	ATTT	m.453_455dup	455	T	TTTT
68	m.452del	452	T	:	m.455del	455	T	:
69	m.456del	456	C	:	m.459del	459	C	:
70	m.461del	461	C	:	m.463del	463	C	:
71	m.467del	467	C	:	m.469del	469	C	:
72	m.492del	492	A	:	m.493del	493	A	:
73	m.494del	494	C	:	m.498del	498	C	:
74	m.500del	500	C	:	m.502del	502	C	:
75	m.509del	509	C	:	m.511del	511	C	:
76	m.512_513insGC	512	A	AGC	m.513_514dup	514	C	CGC
77	m.512_513insGCAC	512	A	AGCAC	m.513_516dup	516	C	CGCAC
78	m.513_514insCA	513	G	GCA	m.522_523dup	523	A	ACA
79	m.513_514insCACA	513	G	GCACA	m.520_523dup	523	A	ACACA
80	m.513_514insCACACA	513	G	GCACACA	m.518_523dup	523	A	ACACACA
81	m.513_514insCACACACA	513	G	GCACACACA	m.516_523dup	523	A	ACACACACA
82	m.513_514insCACACACACA	513	G	GCACACACACA	m.514_523dup	523	A	ACACACACACA
83	m.514_515del	514	CA	:	m.522_523del	522	CA	:
84	m.514_517del	514	CACA	:	m.520_523del	520	CACA	:
85	m.515_516insCC	515	A	ACC	m.516_517insCC	516	C	CCC
86	m.520_521insACA	520	C	CACA	m.521_523dup	523	A	AACA
87	m.521_522insCACC	521	A	ACACC	m.522_525dup	525	C	CCACC
88	m.521_522insCC	521	A	ACC	m.522_523insCC	522	C	CCC
89	m.523_524insCC	523	A	ACC	m.524_525dup	525	C	CCC
90	m.524del	524	C	:	m.525del	525	C	:
91	m.534del	534	C	:	m.537del	537	C	:
92	m.541del	541	C	:	m.544del	544	C	:
93	m.548del	548	C	:	m.549del	549	C	:
94	m.550del	550	A	:	m.551del	551	A	:
95	m.564_565insAC	564	G	GAC	m.567_568dup	568	C	CAC
96	m.565_566insCC	565	A	ACC	m.566_567insCC	566	C	CCC
97	m.565_566insCCCC	565	A	ACCCC	m.566_567insCCCC	566	C	CCCCC
98	m.565_566insCCCCC	565	A	ACCCCC	m.566_567insCCCCC	566	C	CCCCCC
99	m.565_566del	565	AC	:	m.567_568del	567	AC	:
100	m.567_568insCC	567	A	ACC	m.572_573dup	573	C	CCC
101	m.567_568insCCC	567	A	ACCC	m.571_573dup	573	C	CCCC
102	m.567_568insCCCC	567	A	ACCCC	m.570_573dup	573	C	CCCCC
103	m.567_568insCCCCC	567	A	ACCCCC	m.569_573dup	573	C	CCCCCC
104	m.567_568insCCCCCC	567	A	ACCCCCC	m.568_573dup	573	C	CCCCCCC
105	m.567_568insCCCCCCC	567	A	ACCCCCCC	m.573_574insCCCCCCC	573	C	CCCCCCCC
106	m.567_568insCCCCCCCCC	567	A	ACCCCCCCCC	m.573_574insCCCCCCCCC	573	C	CCCCCCCCCC
107	m.568del	568	C	:	m.573del	573	C	:
108	m.568_570del	568	CCC	:	m.571_573del	571	CCC	:
109	m.573_574del	573	CA	:	m.575_576del	575	CA	:
110	m.588del	588	T	:	m.589del	589	T	:
111	m.730del	730	A	:	m.732del	732	A	:
112	m.781del	781	A	:	m.784del	784	A	:
113	m.802del	802	C	:	m.806del	806	C	:
114	m.865del	865	A	:	m.866del	866	A	:
115	m.867del	867	C	:	m.870del	870	C	:
116	m.955_956insCC	955	A	ACC	m.959_960dup	960	C	CCC
117	m.955_956insCCC	955	A	ACCC	m.958_960dup	960	C	CCCC
118	m.955_956insCCCC	955	A	ACCCC	m.957_960dup	960	C	CCCCC
119	m.955_956insCCCCC	955	A	ACCCCC	m.956_960dup	960	C	CCCCCC
120	m.955_956insCCCCCC	955	A	ACCCCCC	m.960_961insCCCCCC	960	C	CCCCCCC
121	m.956del	956	C	:	m.960del	960	C	:
122	m.962del	962	C	:	m.965del	965	C	:
123	m.993del	993	A	:	m.998del	998	A	:
124	m.1166del	1166	A	:	m.1168del	1168	A	:
125	m.1220del	1220	A	:	m.1222del	1222	A	:
126	m.1408del	1408	A	:	m.1409del	1409	A	:
127	m.1421del	1421	G	:	m.1422del	1422	G	:
128	m.1655del	1655	A	:	m.1656del	1656	A	:
129	m.1789del	1789	A	:	m.1790del	1790	A	:
130	m.2072del	2072	A	:	m.2074del	2074	A	:
131	m.2130del	2130	A	:	m.2135del	2135	A	:
132	m.2141_2142insAG	2141	T	TAG	m.2148_2149dup	2149	G	GAG
133	m.2226_2227insAA	2226	T	TAA	m.2231_2232dup	2232	A	AAA
134	m.2227del	2227	A	:	m.2232del	2232	A	:
135	m.2394del	2394	A	:	m.2395del	2395	A	:
136	m.2466del	2466	A	:	m.2469del	2469	A	:
137	m.2790del	2790	A	:	m.2792del	2792	A	:
138	m.2832del	2832	A	:	m.2833del	2833	A	:
139	m.2885_2886del	2885	TA	:	m.2887_2888del	2887	TA	:
140	m.2937del	2937	A	:	m.2938del	2938	A	:
141	m.3116del	3116	C	:	m.3117del	3117	C	:
142	m.3135del	3135	A	:	m.3136del	3136	A	:
143	m.3153del	3153	T	:	m.3154del	3154	T	:
144	m.3158del	3158	A	:	m.3160del	3160	A	:
145	m.3204del	3204	C	:	m.3206del	3206	C	:
146	m.4313del	4313	T	:	m.4314del	4314	T	:
147	m.4315del	4315	A	:	m.4317del	4317	A	:
148	m.4400del	4400	A	:	m.4402del	4402	A	:
149	m.5744del	5744	G	:	m.5746del	5746	G	:
150	m.5747del	5747	A	:	m.5752del	5752	A	:
151	m.5810del	5810	A	:	m.5813del	5813	A	:
152	m.5889_5890insCC	5889	A	ACC	m.5890_5891dup	5891	C	CCC
153	m.5892_5893insCC	5892	T	TCC	m.5893_5894insCC	5893	C	CCC
154	m.5892_5893insCCC	5892	T	TCCC	m.5893_5894insCCC	5893	C	CCCC
155	m.5892_5893insCCCCC	5892	T	TCCCCC	m.5893_5894insCCCCC	5893	C	CCCCCC
156	m.5892_5893insCCCCCCC	5892	T	TCCCCCCC	m.5893_5894insCCCCCCC	5893	C	CCCCCCCC
157	m.5892_5893insCCCCCCCC	5892	T	TCCCCCCCC	m.5893_5894insCCCCCCCC	5893	C	CCCCCCCCC
158	m.5894_5895insCC	5894	A	ACC	m.5898_5899dup	5899	C	CCC
159	m.5894_5895insCCC	5894	A	ACCC	m.5897_5899dup	5899	C	CCCC
160	m.5894_5895insCCCC	5894	A	ACCCC	m.5896_5899dup	5899	C	CCCCC
161	m.5894_5895insCCCCC	5894	A	ACCCCC	m.5895_5899dup	5899	C	CCCCCC
162	m.5894_5895insCCCCCC	5894	A	ACCCCCC	m.5899_5900insCCCCCC	5899	C	CCCCCCC
163	m.5894_5895insCCCCCCC	5894	A	ACCCCCCC	m.5899_5900insCCCCCCC	5899	C	CCCCCCCC
164	m.5894_5895insCCCCCCCC	5894	A	ACCCCCCCC	m.5899_5900insCCCCCCCC	5899	C	CCCCCCCCC
165	m.5894_5895insCCCCCCCCC	5894	A	ACCCCCCCCC	m.5899_5900insCCCCCCCCC	5899	C	CCCCCCCCCC
166	m.5894_5895insCCCCCCCCCC	5894	A	ACCCCCCCCCC	m.5899_5900insCCCCCCCCCC	5899	C	CCCCCCCCCCC
167	m.5895del	5895	C	:	m.5899del	5899	C	:
168	m.5900_5901insCC	5900	A	ACC	m.5901_5902insCC	5901	C	CCC
169	m.5900_5901insCCC	5900	A	ACCC	m.5901_5902insCCC	5901	C	CCCC
170	m.6072_6073insTCG	6072	A	ATCG	m.6073_6075dup	6075	G	GTCG
171	m.6321del	6321	G	:	m.6322del	6322	G	:
172	m.6576del	6576	G	:	m.6577del	6577	G	:
173	m.7466del	7466	C	:	m.7471del	7471	C	:
174	m.7502del	7502	C	:	m.7503del	7503	C	:
175	m.7515del	7515	A	:	m.7519del	7519	A	:
176	m.7569del	7569	A	:	m.7571del	7571	A	:
177	m.8270_8271insACCCCCTCT	8270	C	CACCCCCTCT	m.8280_8288dup	8288	T	TACCCCCTCT
178	m.8270_8271insACCCCCTCTACCCCCTCT	8270	C	CACCCCCTCTACCCCCTCT	m.8271_8288dup	8288	T	TACCCCCTCTACCCCCTCT
179	m.8271_8272insCC	8271	A	ACC	m.8275_8276dup	8276	C	CCC
180	m.8271_8272insCCC	8271	A	ACCC	m.8274_8276dup	8276	C	CCCC
181	m.8271_8272insCCCC	8271	A	ACCCC	m.8273_8276dup	8276	C	CCCCC
182	m.8271_8279del	8271	ACCCCCTCT	:	m.8280_8288del	8280	ACCCCCTCT	:
183	m.8272del	8272	C	:	m.8276del	8276	C	:
184	m.8276_8277del	8276	CT	:	m.8278_8279del	8278	CT	:
185	m.8280_8281insCC	8280	A	ACC	m.8284_8285dup	8285	C	CCC
186	m.8280_8281insCCC	8280	A	ACCC	m.8283_8285dup	8285	C	CCCC
187	m.8280_8281insCCCC	8280	A	ACCCC	m.8282_8285dup	8285	C	CCCCC
188	m.8281del	8281	C	:	m.8285del	8285	C	:
189	m.8510del	8510	A	:	m.8512del	8512	A	:
190	m.9532del	9532	C	:	m.9537del	9537	C	:
191	m.9957del	9957	T	:	m.9959del	9959	T	:
192	m.10004del	10004	A	:	m.10006del	10006	A	:
193	m.11032del	11032	A	:	m.11038del	11038	A	:
194	m.11374del	11374	A	:	m.11376del	11376	A	:
195	m.12195_12196insCCT	12195	C	CCCT	m.12196_12198dup	12198	T	TCCT
196	m.12237del	12237	C	:	m.12241del	12241	C	:
197	m.12418del	12418	A	:	m.12425del	12425	A	:
198	m.15367del	15367	C	:	m.15371del	15371	C	:
199	m.16037del	16037	A	:	m.16038del	16038	A	:
200	m.16044del	16044	T	:	m.16046del	16046	T	:
201	m.16052del	16052	C	:	m.16053del	16053	C	:
202	m.16055del	16055	C	:	m.16057del	16057	C	:
203	m.16058del	16058	A	:	m.16059del	16059	A	:
204	m.16063del	16063	T	:	m.16064del	16064	T	:
205	m.16071del	16071	C	:	m.16073del	16073	C	:
206	m.16082del	16082	C	:	m.16083del	16083	C	:
207	m.16101del	16101	T	:	m.16102del	16102	T	:
208	m.16111del	16111	C	:	m.16112del	16112	C	:
209	m.16129del	16129	G	:	m.16130del	16130	G	:
210	m.16133del	16133	C	:	m.16134del	16134	C	:
211	m.16137del	16137	A	:	m.16139del	16139	A	:
212	m.16162del	16162	A	:	m.16166del	16166	A	:
213	m.16170del	16170	A	:	m.16171del	16171	A	:
214	m.16180del	16180	A	:	m.16183del	16183	A	:
215	m.16180_16181del	16180	AA	:	m.16182_16183del	16182	AA	:
216	m.16183_16184insCC	16183	A	ACC	m.16187_16188dup	16188	C	CCC
217	m.16183_16184insCCC	16183	A	ACCC	m.16186_16188dup	16188	C	CCCC
218	m.16183_16184insCCCC	16183	A	ACCCC	m.16185_16188dup	16188	C	CCCCC
219	m.16184del	16184	C	:	m.16188del	16188	C	:
220	m.16190del	16190	C	:	m.16193del	16193	C	:
221	m.16198del	16198	T	:	m.16199del	16199	T	:
222	m.16215del	16215	A	:	m.16216del	16216	A	:
223	m.16221del	16221	C	:	m.16223del	16223	C	:
224	m.16240del	16240	A	:	m.16241del	16241	A	:
225	m.16246del	16246	A	:	m.16247del	16247	A	:
226	m.16252del	16252	A	:	m.16254del	16254	A	:
227	m.16256del	16256	C	:	m.16257del	16257	C	:
228	m.16271_16272insAG	16271	T	TAG	m.16272_16273dup	16273	G	GAG
229	m.16283del	16283	A	:	m.16285del	16285	A	:
230	m.16290del	16290	C	:	m.16292del	16292	C	:
231	m.16294del	16294	C	:	m.16296del	16296	C	:
232	m.16297del	16297	T	:	m.16298del	16298	T	:
233	m.16316del	16316	A	:	m.16318del	16318	A	:
234	m.16323del	16323	T	:	m.16325del	16325	T	:
235	m.16375del	16375	C	:	m.16380del	16380	C	:
236	m.16393del	16393	C	:	m.16395del	16395	C	:

Topic revision: r1 - 20 Jan 2023, UnknownUser

MITOMAP

POLG Server
MitoScape ^NEW

Tools
Help
Search
Index

Service provided by the

Center for Mitochondrial
& Epigenomic Medicine
at the Children's Hospital
of Philadelphia

Copyright © by the contributing authors. All material on this collaboration platform is the property of the contributing authors.
Ideas, requests, problems regarding Foswiki? Send feedback